總氮在線監測中存在的問題主要是總氮低于氨氮和K2S3O8的空白值不合理。總氮包括有機氮和無機氮，總氮的在線監測的測定方法是將水樣消解氧化為硝酸鹽-氮后進行測定。

總氮的在線監測采用的方法是過硫酸鹽消解-光度法，通常總氮包括氨氮，所以總氮不可能低于氨氮。

但是總氮在線監測中出現總氮低于氨氮的情況，有可能是由于實驗室環境問題，空氣中常常含有氨和銨鹽，氨和銨鹽又都極易溶于水，所以會使氨氮含量升高，使測量結果出現誤差，產生總氮低于氨氮的情況。

K2S3O8中含氧化合物若到達一定程度，會造成試劑空白的吸光速度增高，從而超過吸光值。因此不合理的扣除K2S3O8，會直接造成整個水質監測數據的錯誤。

解決K2S3O8空白值的問題要先確定試驗用水是無氨水，在取用后馬上加蓋；每瓶K2S3O8只是做6個試劑空白，統計檢驗后取均值作為空白值扣除；如果K2S3O8空白較高，可提純后使用，將K2S2O8溶于50～60攝氏度的無氨水中，在無氨的潔凈處自然冷卻至室溫后，置于約4攝氏度的冰箱中，用玻璃砂漏斗濾出結晶后，用紅外燈烘干。

如果含氮化合物高于0.005%時，須將前述重結晶步驟重復一次。